Tốt Tin sinh học Cho Linux

Xây dựng hệ thống giống như make thường được sử dụng để tạo ra các quy trình công việc phức tạp, ví dụ: trong tin sinh học & nbsp;. snakemake nhằm giảm sự phức tạp của việc tạo ra các luồng công việc bằng cách cung cấp một tên miền cụ thể ngôn ngữ đặc tả...

CLC DNA Workbench tạo ra một môi trường phần mềm cho phép người dùng thực hiện một số lượng lớn các trình tự DNA tiên tiến phân tích, kết hợp với quản lý dữ liệu mịn, và xem và lựa chọn sản lượng đồ họa tuyệt vời.CLC DNA Workbench có sẵn trên Windows, Mac...

seriesoftubes là một đường ống dài cho Solexa dữ liệu ChIP-seq.Tài liệu gói Yêu cầu : ...

Các dự án STEME bắt đầu cuộc sống như là một xấp xỉ với các thuật toán Expectation-Maximisation cho các loại mô hình được sử dụng trong Finders motif như MEME.STEME & rsquo; s EM xấp xỉ chạy một đơn đặt hàng của các cường độ nhanh hơn so với việc thực...

Genepidgin là một bộ công cụ hỗ trợ Python rằng trong đánh giá và gen chuyển nhượng tên sản phẩm & nbsp; Có ba phần chính.:genepidgin * sạch *& Nbsp; chuẩn hóa tên gen theo hướng dẫn đặt tên UNIPROTgenepidgin * so sánh *& Nbsp; so sánh hai hay nhiều tập...

MISO (Hỗn hợp đồng dạng) là một khuôn khổ xác suất viết bằng Python mà quantitates mức độ biểu hiện & nbsp; của các gen cách khác ghép từ dữ liệu RNA-Seq, và xác định đồng dạng theo kiểu khác quy định hoặc exon cả các mẫu.Bằng cách mô phỏng các quá trình...

Pathomx (trước đây là MetaPath) là một phần mềm đồ họa mã nguồn mở thực hiện trong IPython, Qt và PyQt, được thiết kế từ mặt đất lên để hoạt động như một tiện ích tương tác cho trực quan và phân tích các dữ liệu trao đổi chất dưới GNU / Linux và POSIX...

Burrows-Wheeler Aligner (BWA) là một chương trình hiệu quả mà gắn trình tự nucleotide tương đối ngắn so với một chuỗi tham khảo lâu dài như các bộ gen của con người.Phần mềm này thực hiện hai thuật toán, BWA-ngắn và BWA-SW. Các công trình cũ cho truy vấn...

avalanchetoolbox là một hộp công cụ để xác định và mô tả các quá trình phân nhánh, như tuyết lở thần kinh Yêu cầu . ...

OpenElectrophy là một khuôn khổ để tạo thuận lợi cho thao tác, lưu trữ và phân tích các dữ liệu điện sinh. Nó có thể nhập dữ liệu từ nhiều định dạng tập tin khác nhau và lưu trữ chúng trong một cơ sở dữ liệu SQL-loại duy nhất.Công cụ phân tích trong...