Tốt Tin sinh học Cho Linux
Genepidgin là một bộ công cụ hỗ trợ Python rằng trong đánh giá và gen chuyển nhượng tên sản phẩm & nbsp; Có ba phần chính.:genepidgin * sạch *& Nbsp; chuẩn hóa tên gen theo hướng dẫn đặt tên UNIPROTgenepidgin * so sánh *& Nbsp; so sánh hai hay nhiều tập...
BƯỚC là một gói phần mềm để mô phỏng ngẫu nhiên chính xác của hệ thống phản ứng khuếch tán trong hình học 3D tự ý phức tạp. Thuật toán mô phỏng của chúng ta là một thực hiện của SSA Gillespie, mở rộng để đối phó với sự khuếch tán của các phân tử qua các...
TRMiner là một tiện ích Python mà nhằm mục đích giám tuyển các dữ liệu khoa học & nbsp;. Nó cho phép nhanh chóng tỉa bộ sưu tập lớn các ấn phẩm khoa học cho câu liên quan cho một mục tiêu khai thác được.Điều này đạt được trong hai bước. Đầu tiên, các văn...
Hệ thống Benchmark Bioinformatics là một nỗ lực để xây dựng một khuôn khổ hợp lý kiểm tra, kiểm tra, và dữ liệu, cho phép người dùng cuối và các nhà cung cấp để thăm dò hiệu suất của hệ thống của họ.Những gì chúng tôi đang cố gắng làm là để tạo ra một...
Staden Package là một bộ phát triển đầy đủ của lắp ráp chuỗi DNA (Gap4), chỉnh sửa và công cụ phân tích (spin) cho Unix, Linux, MacOSX và MS Windows.Trên mặt trận Gap4 đã có một số trẻ vị thành niên tham gia có liên quancải tiến trong cách điểm số tham...
Arem là một dựa trên MACS (Model Phân tích dựa trên các dữ liệu ChIP-Seq).Thông lượng cao cùng với chuỗi nhiễm sắc kết tủa miễn dịch (ChIP-Seq) được sử dụng rộng rãi trong việc mô tả toàn bộ gen mẫu ràng buộc của yếu tố phiên mã, đồng yếu tố, bổ...
seriesoftubes là một đường ống dài cho Solexa dữ liệu ChIP-seq.Tài liệu gói
Yêu cầu :
...
MetagenomeDB là một thư viện Python được thiết kế để dễ dàng lưu trữ, truy xuất và chú thích các chuỗi metagenomic & nbsp;. MetagenomeDB hành động như một lớp trừu tượng trên đầu trang của một cơ sở dữ liệu MongoDB. Nó cung cấp một API để tạo và sửa đổi...
Seal là một mô-đun Python cung cấp sự liên kết tự trên Hadoop.Seal là một ứng dụng của MapReduce cho sự liên kết chuỗi sinh học. Nó chạy trên Hadoop (http://hadoop.apache.org) thông qua Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), một Python MapReduce và HDFS...
MISO (Hỗn hợp đồng dạng) là một khuôn khổ xác suất viết bằng Python mà quantitates mức độ biểu hiện & nbsp; của các gen cách khác ghép từ dữ liệu RNA-Seq, và xác định đồng dạng theo kiểu khác quy định hoặc exon cả các mẫu.Bằng cách mô phỏng các quá trình...
