Tốt Tin sinh học Cho Linux

picme là một gói Python có chứa chương trình để ước lượng và mưu informativeness phát sinh loài cho các tập dữ liệu lớn. Cài đặt Đối với thời điểm này, cách đơn giản nhất để cài đặt chương trình là:git clone git: //github.com/faircloth-lab/picme.git /...

Pathomx (trước đây là MetaPath) là một phần mềm đồ họa mã nguồn mở thực hiện trong IPython, Qt và PyQt, được thiết kế từ mặt đất lên để hoạt động như một tiện ích tương tác cho trực quan và phân tích các dữ liệu trao đổi chất dưới GNU / Linux và POSIX...

Ghemical là một gói phần mềm hóa học tính toán được lưu hành theo GNU GPL. Nó có nghĩa là toàn bộ mã nguồn của các gói có sẵn, và người dùng có thể tự do nghiên cứu và sửa đổi các gói. Ghemical được viết bằng C ++.Dự án Ghemical có một giao diện người...

LSim superposes mật độ electron phân tử và tính toán một số điểm tương đồng về cấu trúc. Tính toán của nó quy mô tuyến tính với kích thước của các phân tử được so sánh.Việc sắp xếp, LSim được khái niệm liên quan đến các yếu tố cấu trúc sinh hóa và, do đó,...

ProteinShop là một công cụ tương tác cho các thao tác cấu trúc protein. Nó được thiết kế để nhanh chóng tạo ra một tập hợp các cấu hình protein sử dụng kiến ​​thức của con người và trực giác. Các cấu hình có thể phải chịu tối ưu hóa địa phương hay toàn...

Syntainia là một ứng dụng tiên tiến cho hình dung của nhiều bộ gen. & Nbsp; Nó trình bày một giao diện người dùng đơn giản và trực quan để xem và thao tác các mối quan hệ giữa các nhóm của các gen. Với một hình dung rõ ràng hơn gen, nó là dễ dàng hơn cho...

PEAT là một bộ các phần mềm để chụp hình, dự đoán và phân tích các đặc điểm sinh học của protein.Xem http://enzyme.ucd.ie/PEAT cho tài liệu, hướng dẫn, ảnh chụp màn hình vv Yêu cầu . ...

edittag là một bộ sưu tập ứng dụng cho thiết kế bộ chỉnh sửa thẻ chuỗi số liệu, kiểm tra thẻ tự cho cấu để chỉnh sửa số liệu, và tích hợp thẻ tự để adapter sequencing nền tảng cụ thể và mồi PCR. edittag khác với phương pháp tiếp cận khác:& Nbsp; * edittag...

reciprocal_smallest_distance là một thuật toán orthology cặp có sử dụng liên kết chuỗi toàn cầu và khả năng tối đa khoảng cách giữa các chuỗi tiến hóa để phát hiện chính xác orthologs giữa bộ gen. Cài đặt Từ một Tarball Tải về và giải nén phiên bản mới...

Xây dựng hệ thống giống như make thường được sử dụng để tạo ra các quy trình công việc phức tạp, ví dụ: trong tin sinh học & nbsp;. snakemake nhằm giảm sự phức tạp của việc tạo ra các luồng công việc bằng cách cung cấp một tên miền cụ thể ngôn ngữ đặc tả...