Tốt Tin sinh học Cho Linux

MetagenomeDB là một thư viện Python được thiết kế để dễ dàng lưu trữ, truy xuất và chú thích các chuỗi metagenomic & nbsp;. MetagenomeDB hành động như một lớp trừu tượng trên đầu trang của một cơ sở dữ liệu MongoDB. Nó cung cấp một API để tạo và sửa đổi...

SSuMMo là một thư viện các chức năng được thiết kế xung quanh lặp đi lặp lại sử dụng hmmer gán chuỗi để đơn vị phân loại & nbsp;. Kết quả là cây chú thích rất cao cho thấy loài / phân phối chi trong cộng đồng đó.Các chương trình có sẵn với mã nguồn bao...

tigreBrowser là một gen biểu hiện mô hình trình duyệt cho kết quả từ gói R tigre (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Cài đặt: tigreBrowser đòi hỏi Python phiên bản> = 2.5. tigreBrowser có thể được cài đặt với các lệnh sau...

MACS2 là một công cụ phân tích dựa trên mô hình dữ liệu cho ChIP-Seq.Với sự cải tiến của kỹ thuật giải trình tự, chromatin immunoprecipitation tiếp theo trình tự thông lượng cao (ChIP-Seq) đang nhận được phổ biến để nghiên cứu sự tương tác protein-DNA...

edittag là một bộ sưu tập ứng dụng cho thiết kế bộ chỉnh sửa thẻ chuỗi số liệu, kiểm tra thẻ tự cho cấu để chỉnh sửa số liệu, và tích hợp thẻ tự để adapter sequencing nền tảng cụ thể và mồi PCR. edittag khác với phương pháp tiếp cận khác:& Nbsp; * edittag...

MacMolPlt là một chương trình đồ họa hiện đại cho âm mưu cấu trúc phân tử 3-D và các chế độ bình thường (rung động). Phương tiện hiện...

picme là một gói Python có chứa chương trình để ước lượng và mưu informativeness phát sinh loài cho các tập dữ liệu lớn. Cài đặt Đối với thời điểm này, cách đơn giản nhất để cài đặt chương trình là:git clone git: //github.com/faircloth-lab/picme.git /...

SyntenyMiner là một ứng dụng để hình dung và thẩm vấn những so sánh giữa nhiều trình tự bộ gen hoàn chỉnh. Giao diện này cung cấp một cái nhìn hải ở trận đấu tới một trình tự bộ gen tham khảo. Trình tự phù hợp giữa các nhiễm sắc thể của bộ gen khác nhau...

ProteinShop là một công cụ tương tác cho các thao tác cấu trúc protein. Nó được thiết kế để nhanh chóng tạo ra một tập hợp các cấu hình protein sử dụng kiến ​​thức của con người và trực giác. Các cấu hình có thể phải chịu tối ưu hóa địa phương hay toàn...

PySCeS là một dự án được phát triển bởi các Triple-J Nhóm cho Cell Molecular Physiology & nbsp;. Để thử mô hình và hiểu được quá trình phức tạp và hệ thống tạo nên các tế bào sống Tính năng . Một văn bản dựa trên ngôn ngữ mô tả mô hình Một module...