CLC DNA Workbench

CLC DNA Workbench tạo ra một môi trường phần mềm cho phép người dùng thực hiện một số lượng lớn các trình tự DNA tiên tiến phân tích, kết hợp với quản lý dữ liệu mịn, và xem và lựa chọn sản lượng đồ họa tuyệt vời.
CLC DNA Workbench có sẵn trên Windows, Mac OS X, và các nền tảng Linux

Tính năng .

• Tin sinh học có trong Gene Workbench :
• xem linh hoạt của các phân tử tròn.
• Editor cho thiết kế đồ họa mồi và thuật toán tiên tiến
• hội của dữ liệu trình tự DNA
• nhân bản phân tử
• Automatic SNP chú thích của các trình tự
• Tìm kiếm và phát hiện các mẫu DNA
• phân tích khu vực phức tạp địa phương
• dịch Xếp từ protein đến gen, dựa trên các bảng thông dịch từ một số loài
• Advanced phân tích enzyme hạn chế và quản lý
• Dot âm mưu phân tích dựa trên
• thống kê DNA dạng ngắn trong đó có một số đặc điểm của một phân tử cho
• NCBI tìm kiếm dữ liệu trình tự
• Truy cập vào thông tin web từ PubMed
• Các tính năng sinh học khác:
• DNA, RNA và biên tập chuỗi protein hiển thị cả hai tuyến tính và phân tử tròn
• DNA, RNA, và biên tập chỉnh protein
• logo tương tác dọc theo hai DNA, RNA và protein sắp xếp
• Xử lý hàng loạt các phân tích trên nhiều trình tự trong một công việc bước
• Tìm kiếm Motif
• Phát hiện mẫu (mẫu chưa biết)
• Advanced tái chỉnh và khắc phục điểm hình chỉnh
• đồ trình tự biểu tượng dọc theo DNA, RNA, protein và sắp xếp
• chú thích bằng tay của chuỗi
• tìm kiếm tích hợp PubMed
• Tìm kiếm trình tự dựa trên Web bằng cách sử dụng BLAST
• Dot âm mưu phân tích dựa trên
• khu vực phức tạp địa phương phân tích và các lô phức tạp
• đồ thị Gap phần
• G / C phân tích nội dung và đồ thị
• Dự án và quản lý dữ liệu:
• Tích hợp đầy đủ các dữ liệu đầu vào, quản lý dữ liệu, kết quả tính toán, và dữ liệu xuất khẩu
• Chi tiết lịch sử đăng nhập
• Tất cả các loại tập tin có thể được lưu trong các dự án địa phương, và đưa ra từ chương trình
• Nhập và xuất dữ liệu trong một số lượng lớn các định dạng tập tin
• Option làm việc trong một số không gian làm việc hoạt động tại một thời gian, tạo điều kiện cho công việc đồng thời trên nhiều dự án
• Import các file dữ liệu theo dõi và điểm chất lượng từ các máy sequening DNA tự động bằng cách sử dụng tiêu chuẩn sắc ký đồ Format, định dạng ABI và định dạng PHD (PHRED)
• Xem và báo cáo:
• view BLAST Advanced
• đồ thị chi tiết xem
• xem biểu đồ chi tiết
• Advanced xem dot lô
• Tìm kiếm đặc trưng trong các trình tự và sắp xếp

Yêu cầu :

• 256 MB RAM cần thiết
• 512 MB RAM
• 1024 x 768 hiển thị được đề nghị

Hạn chế :

• bản demo 4 tuần đầy đủ chức năng