LSim

LSim superposes mật độ electron phân tử và tính toán một số điểm tương đồng về cấu trúc. Tính toán của nó quy mô tuyến tính với kích thước của các phân tử được so sánh.
Việc sắp xếp, LSim được khái niệm liên quan đến các yếu tố cấu trúc sinh hóa và, do đó, là không thiên vị và thích hợp cho các nghiên cứu tương tự protein cấu trúc-only.
Cài đặt:
Giải nén tập tin phân phối:
tar -xzvf lsim-linux.tar.gz
Di chuyển vào thư mục file:
cd lsim.1.0.0
Sao chép, di chuyển hoặc liên kết các tập tin thực thi lsim đến một vị trí thích hợp -và chắc chắn lsim có thể truy cập thông qua môi trường variable- PATH, ví dụ như:
cp lsim / usr / local / bin
Đặt LSIMDIR biến để trỏ đến thư mục LSim chọn, ví dụ như:
setenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0