Mới Tin sinh học Cho Linux

Seal là một mô-đun Python cung cấp sự liên kết tự trên Hadoop.Seal là một ứng dụng của MapReduce cho sự liên kết chuỗi sinh học. Nó chạy trên Hadoop (http://hadoop.apache.org) thông qua Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), một Python MapReduce và HDFS...

avalanchetoolbox là một hộp công cụ để xác định và mô tả các quá trình phân nhánh, như tuyết lở thần kinh Yêu cầu . ...

Murka là một miễn phí, cross-nền tảng mã nguồn mở và phần mềm dòng lệnh giúp người dùng dễ dàng giải quyết vấn đề Phylogeny, chỉ đơn giản bằng cách sử dụng Networks Median. Nó bao gồm các phương pháp heuristic, thuật toán chính xác, cũng như giải quyết...

. HTSeq là một khuôn khổ Python để xử lý và phân tích dữ liệu từ thông lượng cao sequencing (HTS) xét nghiệm Yêu cầu : < li>...

Orange-Tin sinh học là một gói phần mềm khai thác dữ liệu add-on & nbsp Orange;. Nó kéo dài Orange bằng cách cung cấp các chức năng phổ biến cho các nhiệm vụ cơ bản trong sinh học. Nó cũng cung cấp các vật dụng cho Orange Canvas, cho phép người dùng không...

edittag là một bộ sưu tập ứng dụng cho thiết kế bộ chỉnh sửa thẻ chuỗi số liệu, kiểm tra thẻ tự cho cấu để chỉnh sửa số liệu, và tích hợp thẻ tự để adapter sequencing nền tảng cụ thể và mồi PCR. edittag khác với phương pháp tiếp cận khác:& Nbsp; * edittag...

dự án VULCAN cung cấp tính toán phân tích động lực học chất lỏng.VULCAN (Viscous upwind thuật toán để phân tích dòng chảy Complex) cung cấp động lực học chất lỏng cho tốc độ cận âm thông qua sóng gió siêu thanh phản ứng và không phản ứng dòng chảy trên...

seriesoftubes là một đường ống dài cho Solexa dữ liệu ChIP-seq.Tài liệu gói Yêu cầu : ...

reciprocal_smallest_distance là một thuật toán orthology cặp có sử dụng liên kết chuỗi toàn cầu và khả năng tối đa khoảng cách giữa các chuỗi tiến hóa để phát hiện chính xác orthologs giữa bộ gen. Cài đặt Từ một Tarball Tải về và giải nén phiên bản mới...

Xây dựng hệ thống giống như make thường được sử dụng để tạo ra các quy trình công việc phức tạp, ví dụ: trong tin sinh học & nbsp;. snakemake nhằm giảm sự phức tạp của việc tạo ra các luồng công việc bằng cách cung cấp một tên miền cụ thể ngôn ngữ đặc tả...