QuasiRecomb

QuasiRecomb là một ứng dụng nhẹ chạy trong các lệnh điều khiển, mô phỏng một mô hình Markov để tạo Quasispecies virus. Nó mô tả các thế hệ của quasispecies virus và một phương pháp để suy ra các thông số của nó bằng cách phân tích dữ liệu trình tự thế hệ tiếp theo. Mô hình này được xác nhận trên dữ liệu mô phỏng, thể hiện lợi thế của việc một cách rõ ràng quá trình tái tổ hợp vào tài khoản, và thử nghiệm bằng cách áp dụng cho lần đọc thu được từ các mẫu thử nghiệm HIV. Nó cung cấp một thực hiện của thuật toán EM tìm tối đa ước tính một hậu nghiệm của các thông số mô hình và phương pháp để ước tính sự phân bố của các chủng virus trong quasispecies

Yêu cầu .

Java