Arabidopsis Motif Scanner (AMS) là một ứng dụng Windows chạy trên máy tính địa phương. Nó được phát triển để xây dựng mạng lưới gen bằng cách xác định vị trí của các yếu tố cis-quy trong Arabidopsis thaliana cây mô hình và bằng cách cung cấp một giao diện dễ dàng để đánh giá và đánh giá mối quan hệ gen. Tính năng sáng tạo chính của nó là để kết hợp các vị trí yếu tố cis-quy, NGS và DNA Chip Mảng dữ liệu biểu hiện, chú thích Arabidopsis và tương tác gen đối với việc xác định các mạng gen quy định bởi các yếu tố phiên mã. Trong các nghiên cứu tập trung vào các yếu tố phiên mã chức năng, phần mềm sử dụng các dữ liệu biểu hiện và ràng buộc các họa tiết trang web trong vùng gen qui định để dự đoán gen mục tiêu trực tiếp. Ngoài ra, AMS sử dụng dữ liệu DNA-protein và tương tác proteinprotein để tạo thuận lợi cho việc xác định các con đường trao đổi chất điều tiết bởi các yếu tố phiên mã quan tâm.
Bình luận không