IPod Application Installer II có thể cài đặt bộ nạp khởi động, sửa loader.cfg file, trích xuất nhạc tắt iPod của bạn, chuyển đổi phim sang MPEG-4 (eiter cho iPod, PSP, hoặc chỉ để cho iTunes), cài đặt các module PZ2, cài đặt iBoy, iDoom, iGameGear , sửa...