Tự do Tin sinh học Cho Linux

Seal là một mô-đun Python cung cấp sự liên kết tự trên Hadoop.Seal là một ứng dụng của MapReduce cho sự liên kết chuỗi sinh học. Nó chạy trên Hadoop (http://hadoop.apache.org) thông qua Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), một Python MapReduce và HDFS...

TRMiner là một tiện ích Python mà nhằm mục đích giám tuyển các dữ liệu khoa học & nbsp;. Nó cho phép nhanh chóng tỉa bộ sưu tập lớn các ấn phẩm khoa học cho câu liên quan cho một mục tiêu khai thác được.Điều này đạt được trong hai bước. Đầu tiên, các văn...

Pysam là một mô-đun Python cho việc đọc và thao tác Samfiles & nbsp;. Đó là một wrapper nhẹ của samtools C-API.Hướng dẫn bắt đầu nhanh chóng ở đây. Tài liệu hướng dẫn chi tiết hơn có sẵn ở đây.Các câu hỏi và nhận xét là rất đáng hoan nghênh và cần được...

PySCeS là một dự án được phát triển bởi các Triple-J Nhóm cho Cell Molecular Physiology & nbsp;. Để thử mô hình và hiểu được quá trình phức tạp và hệ thống tạo nên các tế bào sống Tính năng . Một văn bản dựa trên ngôn ngữ mô tả mô hình Một module...

bống là một API Python để đọc các tập tin dữ liệu nhị phân được tạo ra bằng cách sử dụng khung quản lý dữ liệu cá bống tượng next-gen.Thông thường, thư mục này đến như là một phần của gói cá bống tượng hoàn chỉnh, có sẵn từ:& Nbsp; http:...

SSuMMo là một thư viện các chức năng được thiết kế xung quanh lặp đi lặp lại sử dụng hmmer gán chuỗi để đơn vị phân loại & nbsp;. Kết quả là cây chú thích rất cao cho thấy loài / phân phối chi trong cộng đồng đó.Các chương trình có sẵn với mã nguồn bao...

Burrows-Wheeler Aligner (BWA) là một chương trình hiệu quả mà gắn trình tự nucleotide tương đối ngắn so với một chuỗi tham khảo lâu dài như các bộ gen của con người.Phần mềm này thực hiện hai thuật toán, BWA-ngắn và BWA-SW. Các công trình cũ cho truy vấn...

PEAT là một bộ các phần mềm để chụp hình, dự đoán và phân tích các đặc điểm sinh học của protein.Xem http://enzyme.ucd.ie/PEAT cho tài liệu, hướng dẫn, ảnh chụp màn hình vv Yêu cầu . ...

OpenElectrophy là một khuôn khổ để tạo thuận lợi cho thao tác, lưu trữ và phân tích các dữ liệu điện sinh. Nó có thể nhập dữ liệu từ nhiều định dạng tập tin khác nhau và lưu trữ chúng trong một cơ sở dữ liệu SQL-loại duy nhất.Công cụ phân tích trong...

NEO (Neural Ensemble Objects) và là một dự án để cung cấp một tập hợp chung của các lớp cơ sở được sử dụng trong phân tích dữ liệu thần kinh, với mục đích nhận được OpenElectrophy, NeuroTools và các dự án có thể khác với các mục tiêu tương tự gần hơn với...