Các Spindel là một phương pháp khác để xác định sinh học dựa vào độ dài của RNA ribosome (rRNA) vùng gen. Nói chung, sự sắp xếp của rRNA tiểu trình tự gen của các loài khác nhau cho thấy các khu vực bảo tồn luân phiên của nucleotide và sự thay đổi, cả về nucleotide thay thế (thường được gọi là "SNPs") và chèn / xóa (indel) các sự kiện. Sự hiện diện của indels kết quả trong chuỗi có độ dài khác nhau và giới thiệu những khoảng trống trong sự liên kết, thường được biểu thị bằng một dấu gạch ngang "-".
Khái niệm của chúng tôi để nhận dạng sinh học sử dụng các trình tự gen rRNA như sau: vùng bảo tồn này được sử dụng để xác định phân đoạn biến ("Spindel vùng hypervariable"), trong đó một sự kết hợp của chuỗi độ dài là đặc trưng của từng loài (một "profile Spindel"). Như vậy, mỗi loài có thể được xác định bởi một số hồ sơ duy nhất.
Về lý thuyết, một cuộc khảo sát của chỉ 6 vùng hypervariable với 20 alen từng (hoặc 11 khu vực với mỗi 5 alen) là đủ để phân biệt tất cả các loài sinh vật nhân chuẩn trên Trái đất, được ước tính là từ 5 đến 15 triệu trong số. Trong thực tế, Spindel là khả năng phân biệt 93,3% của các loài sinh vật nhân chuẩn với các biến thể trong một loài thấp và độ phân giải cao phát sinh loài.
Bình luận không