MACS2

MACS2 là một công cụ phân tích dựa trên mô hình dữ liệu cho ChIP-Seq.
Với sự cải tiến của kỹ thuật giải trình tự, chromatin immunoprecipitation tiếp theo trình tự thông lượng cao (ChIP-Seq) đang nhận được phổ biến để nghiên cứu sự tương tác protein-DNA genome. Để giải quyết những thiếu của phương pháp phân tích ChIP-Seq mạnh mẽ, chúng tôi trình bày một thuật toán mới, đặt tên là Phân tích Mô hình dựa trên các ChIP-Seq (MACS), để xác định các yếu tố ràng buộc bảng điểm các trang web. MACS chụp các ảnh hưởng của gen phức tạp để đánh giá tầm quan trọng của khu vực ChIP làm giàu, và MACS cải thiện độ phân giải không gian của các ràng buộc các trang web thông qua việc kết hợp các thông tin của cả hai vị trí thẻ trình tự và định hướng. . MACS có thể dễ dàng sử dụng cho dữ liệu ChIP-Seq một mình, hoặc với mẫu đối chứng với sự gia tăng về tính đặc thù

Yêu cầu :

• Python