InterMine

InterMine cung cấp các thói quen truy cập vào datawarehouses trợ bởi công nghệ InterMine.
InterMine là một hệ thống kho dữ liệu mã nguồn mở mạnh mẽ. Sử dụng InterMine, bạn có thể tạo ra cơ sở dữ liệu của dữ liệu sinh học được truy cập bởi các công cụ truy vấn web phức tạp. Phân tích cú pháp được cung cấp cho việc tích hợp dữ liệu từ nhiều định dạng sinh học phổ biến và có một khuôn khổ cho việc thêm dữ liệu của riêng bạn. InterMine bao gồm một hấp dẫn, thân thiện giao diện web hoạt động 'ra khỏi hộp' và có thể dễ dàng tùy chỉnh cho các nhu cầu cụ thể của bạn.
Tất cả các mã InterMine là tự do có sẵn theo giấy phép LGPL

là gì mới trong phiên bản này:.

• Liên kết để InterMine:
• Có nhiều cách mới để liên kết vào Mine của bạn. Xem kết để biết chi tiết.
• định dạng JSON dịch vụ Web:
• Có một số định dạng kết quả webservice mới. Tham gia jsonobjects mà xuất hiện ở 0.95, bây giờ chúng tôi có định dạng JSON cho khá nhiều tất cả mọi thứ khác:
• Kết quả:
• jsonrows - đại diện của bảng dữ liệu với thêm meta-data
• & quot; jsontable & quot; . - Định dạng container để xây dựng mẫu nhúng (xem: imbedding hướng dẫn)
• & quot; số & quot; và & quot; jsoncount & quot; - Định dạng chỉ nhận được số của một truy vấn
• Webservice meta-data (Model và Templates):
• & quot; json & quot; - Phiên bản dễ dàng parsable của mô hình dữ liệu và danh sách mẫu có sẵn
• Xác thực Bây giờ làm việc trong Perl Webservice Khách hàng:
• Người sử dụng của khách hàng Perl Webservice bây giờ có chương trình truy cập vào danh sách của họ và các mẫu tin. Đơn giản chỉ cần cung cấp thông tin đăng nhập của bạn cho khách hàng để truy cập vào tài khoản của bạn (thông tin chi tiết của bạn được truyền đi ở dạng mã hóa). Tính năng này sẽ làm việc với tất cả các mỏ với webservices, không chỉ những người ở 0,96 và ở trên.
• Kết quả Object với khách hàng Webservice:
• Các Perl và Java khách hàng có thể nhận được kết quả như các đối tượng (đối tượng JSON, hoặc trong Perl, thổi phồng lên để đối tượng kết quả đầy đủ). Điều này giúp đơn giản hoá một số vấn đề xử lý dữ liệu phức tạp, và đối phó với ngoài tham gia và các bộ sưu tập.
• Tables nhúng:
• Bạn có thể bây giờ tự nhiên nhúng bảng dữ liệu từ bất kỳ mỏ với một webservice hỗ trợ vào các trang web của bạn với JavaScript và CSS. Xem các imbedding hướng dẫn cho một cuộc biểu tình và giới thiệu về kỹ thuật này. Hãy chắc chắn để chơi xung quanh với các thư viện JavaScript mới có sẵn tại http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Registry:
• Chúng tôi đã đưa ra một dịch vụ trung tâm đăng ký cho việc triển khai InterMine. Điều này sẽ không chỉ phục vụ như là một & quot; vàng trang & quot ;, cho phép du khách khám phá dữ liệu nguồn mới, và tạo điều kiện interoperation giữa các mỏ thân, nhưng nó cũng hỗ trợ các webservices bằng cách cung cấp một đăng ký của các url webservice và các phiên bản. Truy cập vào registry tại http://www.intermine.org/registry, và giúp đỡ trong việc đăng ký mỏ riêng của bạn, hãy truy cập RegisteringYourMine.
• Link Chuyển hướng:
• Bạn có thể thêm một tài sản để có các liên kết trong các trang kết quả chuyển hướng đến bất kỳ URL. Xem LinkRedirects cho biết thêm thông tin.

Nội dung trang
• Trang chủ:
• Các trang chủ cho InterMine bây giờ có thể được cấu hình để hiển thị thông tin khác nhau dựa vào việc có hay không những người dùng mới. Xem HomepageConfig để được hướng dẫn làm thế nào để cấu hình hành vi này.
• tag mới:
• Chúng tôi đã thêm một thẻ mới: im: admin. Nếu bạn đánh dấu một mẫu với im: admin, nó sẽ không hiển thị trong webapp của bạn. Điều này rất hữu ích cho ẩn các mẫu cần thiết bởi webservices InterMine từ người dùng của bạn. Xem Gắn thẻ cho một danh sách của tất cả các thẻ có sẵn.
• Danh sách tải lên:
• Các quá trình tải lên danh sách đã được cải thiện.
• Các thay đổi khác:
• UPDATE - chỉnh thử nghiệm nhiều giả thuyết nghiêm ngặt hơn về các vật dụng làm giàu. & Quot; Số bài kiểm tra & quot; Hiện tại là số lượng các điều khoản liên quan với danh sách tài liệu tham khảo.
• UPDATE - tùy chọn bộ lọc hữu ích hơn trên các vật dụng làm giàu
• NEW - Holm-Bonferroni thêm tùy chọn để các vật dụng làm giàu
• UPDATE - mới & quot; xóa & quot; nút trên trang danh sách
• UPDATE - tương tác displayer nạp thông qua AJAX để báo cáo tải trang nhanh hơn
• FIX - & quot; điểm & quot; hình ảnh hiển thị chính xác trên kết quả tìm kiếm
• UPDATE - QueryBuilder tương tác nhiều hơn, lựa chọn một mục trong danh sách sẽ mang lại cho các mục ban đầu bạn sau khi trang refresh / reload
• UPDATE - liên kết thêm vào tóm tắt cột trong kết quả truy vấn, làm dễ dàng hơn để xem các giá trị khác biệt
• FIX - lỗi đăng nhập tên người dùng liên quan đến trường hợp trộn
• FIX - phụ tùng lỗi khi xem dữ liệu sau khi xuất khẩu phụ tùng
• NEW - truy vấn mẫu được đặt hàng bởi sự phổ biến, trừ khi bạn đã đăng nhập, trong trường hợp họ được sắp xếp theo ngày mỗi truy vấn là chạy cuối cùng
• FIX - Dữ liệu không bị lặp đi lặp lại trong các & quot; quot linh tinh &; phần trên các trang báo cáo
• FIX - các mẫu hiển thị chính xác trên trang báo cáo ngay cả đối với các lớp con
• FIX - mẫu render một cách chính xác trên trang khía cạnh
• UPDATE - cập nhật đổi BioGRID để xử lý những thay đổi trong các tập tin dữ liệu mới nhất
• FIX - khác nhau & quot; vàng & quot; theme CSS và hình ảnh được cải thiện và cập nhật
• FIX - vấn đề an toàn thread giải quyết trong mẫu theo dõi
• UPDATE - bảng widget có thể nhóm bởi một thuộc tính cũng như một lớp học

Yêu cầu :

• Python