CWC Simulator

CWC Simulator là một C ++ thực hiện CWC, một tính toán cho các đại diện và mô phỏng các hệ thống sinh học & nbsp;. Sau khi cài đặt thành công (xem INSTALL) bạn sẽ có thể để chạy mô phỏng trên mô hình CWC, như trong một số ví dụ (xem ví dụ /).
(Command-line) Giao diện
Là một người dùng chung, bạn nên chạy:

model.cwc -i
-o
-t
-s
-n
-c
--qt ngưỡng
-q
-w
Trong đó:
- là tên của file thực thi (mặc định: scwc);
& Nbsp; - model.cwc là chương trình CWC đầu vào (xem ví dụ);
& Nbsp; - số liệu thống kê là sản lượng các tập tin tiền tố;
& Nbsp; - là mô phỏng thời gian giới hạn;
& Nbsp; - là thời gian lấy mẫu (tức là 0.12 để có được 250 điểm với thời gian giới hạn = 30);
& Nbsp; - là số lượng các trường hợp của mô phỏng;
& Nbsp; - là số các cụm k-means
& Nbsp; - là ngưỡng cho QT phân nhóm
& Nbsp; - là số quantiles;
& Nbsp; - có thường để phù hợp với số lượng lõi của hệ thống của bạn (tức là 4 cho CPU quad-core).
Output
Các công cụ sản xuất:
- Một số tập tin .dat (đầu ra mẫu của các mô phỏng)
- Một số kịch bản gnuplot để vẽ analysises thống kê
Chúng tôi đang làm việc tại một hướng dẫn sử dụng toàn diện

Tính năng .

• thuật toán Gillespie SSA trên mô hình CWC
• lai ngẫu nhiên / ngữ nghĩa xác định
• Nhiều trường hợp của mô phỏng với các số liệu thống kê trực tuyến
• Tối ưu hóa cho các kiến ​​trúc đa lõi dựa trên khung FastFlow
• Extensible thống thống kê (có nghĩa là, phương sai, lọc phân nhóm vv.)
• Nhiều ngữ nghĩa giá (hành động đại chúng, Michaelis-Menten, Hill vv.)