công cụ dòng lệnh để so sánh dấu phẩy phân cách các tập tin dữ liệu bằng cách sử dụng sự khác biệt tương đối để xác định conformations giống nhất. Compsort so sánh các tập tin dữ liệu bằng cách sử dụng sự khác biệt tương đối, tính toán một số điểm tương đồng, sắp xếp các điểm theo thứ tự tăng dần (giá trị thấp hơn đại diện cho tương đồng hơn nữa), tiết kiệm X số điểm thấp.
Các tập tin dữ liệu được tạo ra bởi người sử dụng, phải được dấu phẩy tập tin văn bản. Mỗi tập tin đại diện cho một phân tử độc đáo. Mỗi dòng trong một tập tin đại diện cho một dáng độc đáo của các phân tử. Cột đầu tiên trong các tập tin dữ liệu phải là một nhãn hiệu duy nhất cho các cấu đại diện bởi hàng. Các cột còn lại là mô tả số, như các phép đo khoảng cách không gian.
Các hàng được so combinatorially giữa các tập tin. Các nhãn so được nối và lưu lại với điểm số của tập hợp các hàng. Điều này cung cấp một cách để xác định các conformations mà sản xuất một số điểm tương đồng nhất định.
Công việc trong tương lai bao gồm:
- thêm giao diện GUI
- gửi giấy về thuật toán mô hình pharmacophore 3D của tôi
- Một phiên bản song song sử dụng MPI
là gì mới trong phiên bản này:
- cố định một vài tiểu cảnh báo trình biên dịch
- thêm vào báo cáo thời gian tính toán cho bộ tính toán tổ hợp trong ngoài thời gian loại báo cáo trước đây
- tăng mức độ tối ưu hóa trình biên dịch của nhị phân
Yêu cầu :
Mac OS X 10.3
Bình luận không