FlexS

FlexS dự đoán cấu tạo và định hướng của một trong các phối tử liên quan đến một trong những khác. Trong FlexS các tài liệu tham khảo-ligand được giả định là cứng nhắc, do đó, nó phải được đưa ra trong một dáng tương tự như trạng thái bị ràng buộc. Các thuật toán chồng chất trong FlexS chỉ đòi hỏi rất ít can thiệp bằng tay. Bạn có thể tích hợp kiến ​​thức này vào các tính toán với FlexS bằng cách thực hiện các bước đơn bằng tay. Như vậy, FlexS được thiết kế cho việc tương tác trên các cặp phối tử cũng như sàng lọc ảo ligand-based. Hai ứng dụng chính của FlexS là siêu định vị phối tử (ví dụ. Cho COMFA / QSAR) và sàng lọc ảo. Nếu bạn có một loại protein và một phân tử liên kết với nó (được gọi là tài liệu tham khảo-ligand) nhưng không có cấu trúc của protein, bạn có thể đưa các cấu trúc tham chiếu như là một dấu vân tay tiêu cực của các trang web đang hoạt động. FlexS xác định sự giống nhau giữa kiểm tra và cấu trúc tài liệu tham khảo bằng cách xếp chúng. Trong chiếu ảo, bạn có một tài liệu tham khảo-ligand và một tập hợp các hợp chất và bạn quan tâm trong việc ưu tiên các hợp chất để thử nghiệm thực nghiệm.