RAPTOR

RAPTOR là một phần mềm sáng tạo được thiết kế để dự đoán cấu trúc protein chính xác. Nó kết hợp các công cụ phân tích cao cấp trong một giải pháp phần mềm tích hợp và cung cấp ba phương pháp luồng khác nhau. Cách tiếp cận độc đáo tối ưu hóa trình số nguyên RAPTOR là hiệu quả nhất để tìm kiếm cấu trúc mẫu của mục tiêu tương đồng với trình tự thấp và có thể tạo ra mô hình chất lượng cao. Giao diện dễ sử dụng và dễ hiểu giá trị E là lý tưởng cho người mới bắt đầu và các chuyên gia. Trên tất cả, màn hình hiển thị trực quan của các đầu ra cho phép người sử dụng để hiểu được kết quả chỉ trong nháy mắt. Cho một chuỗi protein mục tiêu, nếu có một protein tương đồng với cấu trúc 3D được biết, nó có thể được tìm thấy bằng cách sử dụng công cụ tìm kiếm chuỗi như PSI-BLAST, cũng được cung cấp trong RAPTOR. Cấu trúc của mục tiêu sau đó được xây dựng từ những cấu trúc được biết đến; Tuy nhiên, khi những tương đồng trình tự là không đáng kể, tức là ít hơn 25%, PSI-BLAST không thể đến với một hit tự tin. Không giống như PSI-BLAST, mà chỉ đơn giản là một chuỗi tìm kiếm, luồng protein, gấp công nhận, làm cho sử dụng cả hai tương đồng và cấu trúc thông tin. Nó quét các chuỗi protein có cấu trúc không rõ đối với một cơ sở dữ liệu của cấu trúc được biết đến. Bằng cách sử dụng một chức năng ghi bàn và tiến hành phân tích khả năng tương thích giữa các cấu trúc ba chiều và các chuỗi protein tuyến tính, các mẫu cấu trúc tốt nhất sẽ được xác định từ đó xây dựng cấu trúc của chuỗi. Kết quả là, luồng protein cung cấp cho một dự đoán cao hơn so với mô hình tương đồng khi có biên tương đồng trình tự

Hạn chế .

chức năng TNHH