POY

POY là một chương trình phân tích phát sinh loài hỗ trợ nhiều loại dữ liệu (ví dụ như hình thái, nucleotide, các gen và các vùng gen, nhiễm sắc thể, và toàn bộ hệ gen). POY là đặc biệt ở chỗ nó có thể thực hiện đúng kết và phát sinh học suy luận nghĩa là chuỗi đầu vào không cần phải được prealigned. Chèn thêm, xóa, và sắp xếp lại, sau đó có thể được bao gồm trong tổng số điểm tối đa cây dưới sự cẩn thận, hoặc trong mô hình dưới Maximum Likelihood. Một loạt các thuật toán heuristic đã được phát triển cho mục đích này và được thực hiện trong POY.