misopy

MISO (Hỗn hợp đồng dạng) là một khuôn khổ xác suất viết bằng Python mà quantitates mức độ biểu hiện & nbsp; của các gen cách khác ghép từ dữ liệu RNA-Seq, và xác định đồng dạng theo kiểu khác quy định hoặc exon cả các mẫu.
Bằng cách mô phỏng các quá trình sinh sản của bạn sẽ đọc được sản xuất từ ​​đồng dạng trong RNA-Seq, mô hình MISO sử dụng suy luận Bayes để tính xác suất mà một đọc có nguồn gốc từ một đồng vị đặc biệt.
MISO sử dụng phân cậy của đọc cho đồng dạng để định lượng sự phong phú của các thiết lập cơ bản của đồng dạng mRNA thay thế. Khoảng tin cậy hơn ước tính có thể đạt được, mà định lượng độ tin cậy của các ước tính.
Vui lòng xem http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ cho MISO dẫn sử dụng và tài liệu hướng dẫn

Yêu cầu .

• Python