Bibliosphere Analysis Kit

BiblioSphere cung cấp một sự kết hợp độc đáo của văn học khai thác và phân tích con đường cho các nhà sinh học phân tử quan tâm đến quy định gen và các mạng sinh học.
 BiblioSphere Pathway Edition sử dụng một cơ sở dữ liệu toàn diện về các mối quan hệ theo mô hình riêng lẻ giữa các gen, protein, khu phức hợp, các tế bào và các mô cùng với các kỹ thuật khai thác mỏ up-to-date văn bản để khai thác kiến ​​thức tự động để cho phép bạn liên kết dữ liệu của bạn với các mạng sinh học trong bối cảnh sinh học khác nhau.
 Sử dụng BiblioSphere để

• mở rộng mạng sinh học ngoài thông tin đường kinh điển (Quy định và chuyển hóa)
• hợp nhất kết quả thông lượng cao của bạn với kiến ​​thức sinh học và trình tự phân tích dựa trên
• thực hiện context- phân tích con đường pháp lý nhạy cảm
• tạo thí nghiệm cụ thể biến con đường
• con đường liên kết tới cơ chế gây bệnh và gen
• làm tiên tiến thiết kế thí nghiệm

là gì mới trong phiên bản này:

New và Enhanced Data Sources

• Genomatix Expert giám tuyển Gene-Gene quan hệ:
   Genomatix đã tích hợp độc quyền kiến ​​thức cơ bản của chuyên gia dữ liệu giám tuyển về điều hòa gen vào BiblioSphere. Nguồn dữ liệu độc đáo này cho biết thêm ý nghĩa của mối quan hệ gen gen tới các mạng gen BiblioSphere động tạo ra, cung cấp thông tin như "Gene A kích hoạt phiên mã của gen B" hoặc "Gene Một chất tương tác với gen B".
  
• Signal Dẫn truyền Đại:
   Một số phần của Gene Ontology có liên quan đến việc truyền tín hiệu cũng như dữ liệu được biên soạn từ các tài liệu đã được kết hợp để cho phép xác định con đường kinh điển liên quan đến mạng lưới tập trung.
  
• Metabolic Hội Pathway:
   Hiệp hội đường trao đổi chất đã được tích hợp để cho phép xác định các sự kiện trao đổi chất liên quan đến thiết lập của bạn gen.
  

• Pathway View với chuyên gia giám tuyển các mối quan hệ gen-gen
   Nhóm gen được biên dịch vào đồ thị mạng lưới năng động dễ dàng hiểu được cách kết hợp tay giám tuyển các mối quan hệ gen-gen với dữ liệu thu được từ việc khai thác kiến ​​thức tự động. Mạng có thể được tùy chỉnh bởi các bộ lọc và tập trung một cách gen làm trung tâm để thực hiện phân tích con đường ngắn nhất.
  
• Cellular Localization Xem
   Dựa trên gen GO Các chú thích được giao cho vị trí dưới tế bào của họ và hình dung như là một cách bố trí di động diagrammed, cho phép bạn xác định các khu vực dưới tế bào và ngăn có liên quan đến bộ gen của bạn.
  

• Quản lý dự án: Quản lý các phân tích của mình bằng cách tổ chức chúng vào thư mục dự án. Nhanh chóng truy cập kết quả trước đó với một vài cú click chuột hoặc thêm các tìm kiếm mới cho các dự án hiện có.
  

• cải tiến nhỏ khác nhau và sửa lỗi

Yêu cầu :

• Mac OS X 10.2 hoặc cao hơn
• Java 1.4.1 (update 1 là đề nghị)
• kết nối với internet
• một tài khoản đánh giá Genomatix (miễn phí)