Gabedit

Gabedit là một giao diện đồ họa để Gaussian, Molcas, Molpro và MPQC gói hóa học tính toán.
 
 Gabedit bao gồm các cơ sở đồ họa cho các từ khoá và các tùy chọn, thông số kỹ thuật phân tử và phần đầu vào ther cho ngay cả những loại tính toán tiên tiến nhất Gabedit bao gồm một Builder Molecule tiên tiến.
 
 Bạn có thể sử dụng nó để nhanh chóng phác họa trong các phân tử và kiểm tra chúng trong ba chiều. Bạn có thể xây dựng các phân tử của nguyên tử, nhẫn, nhóm, acid amin và nucleoside. Bạn cũng có thể đọc hình học từ một tập tin. Hầu hết các định dạng tập tin phân tử lớn được hỗ trợ.
 
 Gabedit bao gồm một cửa sổ Tính toán thiết lập Gaussian, Molcas, Molpro và MPQC cho phép bạn thiết lập Gaussian, Molcas, Molpro và MPQC công việc một cách đơn giản và dễ hiểu.
 
 Gabedit bao gồm một trình soạn thảo văn bản để chỉnh sửa Molcas, Molpro, các tập tin đầu vào Gaussian và MPQC.
 
 Gabedit đồ họa có thể hiển thị một loạt các Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC và (một phần) kết quả tính toán ADF, bao gồm những điều sau đây:
 
 ย ท obitan phân tử.
 ย ท bề mặt từ mật độ electron, tiềm năng tĩnh điện, mật độ che chắn NMR, và các tài sản khác.
 ย ท bề mặt có thể được hiển thị ở dạng rắn, trong mờ và dây chế độ lưới.
 ย ท bề mặt có thể được tô điểm bởi một tài sản riêng.
 ย ท Contours (colorcoded).
 ย ท Planes (colorcoded).
 ย ท lưỡng cực
 ย ท trục XYZ và các trục chính của các phân tử.
 ย ท Animation của chế độ bình thường tương ứng với tần số dao động.
 ย ท Hoạt hình về chuyển động quay của hình học, bề mặt, lưỡng cực, xyz và các trục chính của các phân tử.
 ย ท Hoạt hình về đường nét.
 ย ท Animation của máy bay colorcoded.
 
 Gabedit có thể hiển thị IR và Raman tính phổ. Gabedit có thể tạo ra một tập tin povray cho hình học (các nguyên tử + trái phiếu, bao gồm liên kết hydro của), bề mặt (kể cả bề mặt colorcoded), đường nét, máy bay colorcoded.
 
 Gabedit có thể lưu hình ảnh trong PPM, BMP, (JPEG) và định dạng PS. Gabedit có thể tạo ra tự động một loạt các hình ảnh cho hình ảnh động (rung, hội tụ hình học, luân chuyển, đường nét, máy bay colorcoded)

là gì mới trong phiên bản này:

• lỗi nhỏ đã được cố định.
• NWChem hiện đang hỗ trợ.
• Các trò chơi bản Windows hiện đang hỗ trợ.

là gì mới trong phiên bản 2.3.5:.

• lỗi nhỏ đã được cố định
• Các nguyên tử có thể được cố định trong một mô phỏng động lực phân tử.
• Di cư từ Cairo để OpenGL để vẽ các cửa sổ hình học.
• Di cư từ gtkglarea để GtkGLExt.
• song song sử dụng OpenMP.

là gì mới trong phiên bản 2.3.0:.

• lỗi nhỏ đã được cố định
• Người dùng có thể đọc các orbital, hình học và chế độ bình thường từ một tập tin Gaussian fchk.
• Có thể đọc được các orbital từ các định dạng tập tin aux MOPAC mới (bao gồm cả các định dạng nén).
• Một số tùy chọn mới trong XYPlot và ContoursPlot cửa sổ (chèn văn bản, dòng, mũi tên, hình ảnh, các chủ đề mới ...).
• Chiều dài trái phiếu có thể được cố định trong một mô phỏng MD.
• tối ưu hóa một phần bây giờ có thể có tiềm năng MM.
• Thực hiện một công cụ để dự đoán quần chúng và sự phong phú của các đồng vị cho một phân tử nhất định. Thực hiện một công cụ để tính toán độ nhạy cảm electrophin, nucleophin và triệt để cho một phân tử.

là gì mới trong phiên bản 2.2.0:

• lỗi nhỏ đã được cố định
• Tất cả những thay đổi hình học có thể được hoàn tác và làm lại bằng cách sử dụng Undo và Redo (u / U hoặc Ctrl z / Ctrl y)
• Người sử dụng có toàn quyền điều khiển các trái phiếu được hiển thị trong một bản vẽ.
• Các bản vẽ của các nguyên tử phân tử của nguyên tử đã được đơn giản hóa.
• Các bản vẽ của đoạn phân tử của phân mảnh đã được đơn giản hóa.
• Gabedit đọc connectivities từ gabedit, hin, pdb, mol2 và các tập tin mol.
• Người dùng có thể thiết lập giá trị của khoảng cách, góc liên kết và góc nhị diện.
• Một động lực học phân tử tìm kiếm cấu hình không được thực hiện bằng cách sử dụng một tiềm năng MM (Amber 99).
• Một động lực học phân tử tìm kiếm cấu hình không được thực hiện bằng cách sử dụng một phương pháp bán thực nghiệm (từ mở MOPAC hoặc PCGamess).
• Chuyển từ các chức năng vẽ GDK đến Cairo:. Cross-thiết bị Rendering cho Vector Graphics
• Cairo hiện được sử dụng cho các widget XYplot gabedit (được sử dụng bởi gabedit cho quang phổ vẽ).
• Cairo hiện được sử dụng cho các cửa sổ bản vẽ hình học.
• Hình học có thể được xuất khẩu trong eps, ps, pdf hoặc file svg.
• Các đường cong của cửa sổ XYplot có thể được xuất khẩu trong eps, ps, pdf hoặc file svg.
• Công cụ mới cho tính toán khoảng cách giữa 2 điểm trên cửa sổ XYPlot. & Quot; Control + nút shift & quot; có thể được sử dụng để làm một zoom trên cửa sổ XYPlot.
• Các phiên bản mới của PCGamess (đom đóm) bây giờ được hỗ trợ

là gì mới trong phiên bản 2.1.13:

• lỗi nhỏ là fixe
• Một động lực học phân tử tìm kiếm cấu hình không được thực hiện bằng cách sử dụng một tiềm năng MM (Amber 99).
• Một động lực học phân tử tìm kiếm cấu hình không được thực hiện bằng cách sử dụng một tiềm năng Semi-thực nghiệm (dùng MOPAC hoặc PCGAMESS).
• Người ta có thể tối ưu hóa hình học tương tác sử dụng MOPAC hoặc PCGamess bán thực nghiệm phương pháp, từ cửa sổ Draw Geometry
• Chuyển từ các chức năng vẽ GDK đến Cairo: Cross-thiết bị Rendering cho Vector Graphics. Cairo hiện đang được sử dụng cho các widget XYplot gabedit (được sử dụng bởi gabedit cho quang phổ vẽ). Cairo hiện đang sử dụng cho các cửa sổ bản vẽ hình học.
• Hình học có thể được xuất khẩu trong eps, ps, pdf hoặc file svg. Các đường cong của cửa sổ XYplot có thể được xuất khẩu trong eps, ps, pdf hoặc file svg.
• Công cụ mới cho tính toán khoảng cách giữa 2 điểm trên cửa sổ XYPlot. & Quot; Control + nút bên trái & quot; có thể được sử dụng để làm một zoom trên cửa sổ XYPlot.
• Các phiên bản mới của máy tính Gamess / Firefly được hỗ trợ

Yêu cầu :

• gtk +