BioRuby

BioRuby cung cấp một môi trường tích hợp cho Tin sinh học (Sinh học Thông tin khoa học).
Hướng đối tượng ngôn ngữ kịch bản Ruby có nhiều tính năng phù hợp cho nghiên cứu sinh học, ví dụ, cú pháp rõ ràng để thể hiện các đối tượng phức tạp, biểu thức thông thường để xử lý văn bản mạnh mẽ như Perl & rsquo; s, một loạt các thư viện bao gồm cả dịch vụ web vv
Như cú pháp Ruby là đơn giản và rất sạch sẽ, chúng tôi tin rằng nó rất dễ dàng để tìm hiểu cho người mới bắt đầu, dễ sử dụng cho các nhà sinh học, và cũng đủ mạnh mẽ cho các nhà phát triển phần mềm.
Trong BioRuby, các nhà phát triển có thể lấy mục cơ sở dữ liệu sinh học từ các tập tin phẳng, máy chủ web và cơ sở dữ liệu internet quan hệ địa phương.
Những mục cơ sở dữ liệu có thể được phân tích để trích xuất thông tin bạn cần. Chuỗi sinh học có thể được điều trị bằng các phương pháp hoàn thành của Ruby & rsquo; s lớp String và với biểu thức thông thường.
Thư viện có thể được tích hợp với các công cụ như Blast, FASTA, Hmmer và nhiều phần mềm khác để phân tích sinh học.
 BioRuby hỗ trợ các định dạng cơ sở dữ liệu sinh học lớn và cung cấp nhiều cách để truy cập chúng thông qua flatfile lập chỉ mục, SQL, các dịch vụ web vv dịch vụ web khác nhau bao gồm KEGG API có thể được dễ dàng sử dụng bởi BioRuby.

Tính năng :

• BioRuby vỏ
• API
• Tài liệu

Yêu cầu :

• của Ruby 1.8.7 hoặc cao hơn