Đỉnh Tin sinh học Cho Linux

OpenElectrophy là một khuôn khổ để tạo thuận lợi cho thao tác, lưu trữ và phân tích các dữ liệu điện sinh. Nó có thể nhập dữ liệu từ nhiều định dạng tập tin khác nhau và lưu trữ chúng trong một cơ sở dữ liệu SQL-loại duy nhất.Công cụ phân tích trong...

PEAT là một bộ các phần mềm để chụp hình, dự đoán và phân tích các đặc điểm sinh học của protein.Xem http://enzyme.ucd.ie/PEAT cho tài liệu, hướng dẫn, ảnh chụp màn hình vv Yêu cầu . ...

Burrows-Wheeler Aligner (BWA) là một chương trình hiệu quả mà gắn trình tự nucleotide tương đối ngắn so với một chuỗi tham khảo lâu dài như các bộ gen của con người.Phần mềm này thực hiện hai thuật toán, BWA-ngắn và BWA-SW. Các công trình cũ cho truy vấn...

SSuMMo là một thư viện các chức năng được thiết kế xung quanh lặp đi lặp lại sử dụng hmmer gán chuỗi để đơn vị phân loại & nbsp;. Kết quả là cây chú thích rất cao cho thấy loài / phân phối chi trong cộng đồng đó.Các chương trình có sẵn với mã nguồn bao...

bống là một API Python để đọc các tập tin dữ liệu nhị phân được tạo ra bằng cách sử dụng khung quản lý dữ liệu cá bống tượng next-gen.Thông thường, thư mục này đến như là một phần của gói cá bống tượng hoàn chỉnh, có sẵn từ:& Nbsp; http:...

PySCeS là một dự án được phát triển bởi các Triple-J Nhóm cho Cell Molecular Physiology & nbsp;. Để thử mô hình và hiểu được quá trình phức tạp và hệ thống tạo nên các tế bào sống Tính năng . Một văn bản dựa trên ngôn ngữ mô tả mô hình Một module...

Pysam là một mô-đun Python cho việc đọc và thao tác Samfiles & nbsp;. Đó là một wrapper nhẹ của samtools C-API.Hướng dẫn bắt đầu nhanh chóng ở đây. Tài liệu hướng dẫn chi tiết hơn có sẵn ở đây.Các câu hỏi và nhận xét là rất đáng hoan nghênh và cần được...

TRMiner là một tiện ích Python mà nhằm mục đích giám tuyển các dữ liệu khoa học & nbsp;. Nó cho phép nhanh chóng tỉa bộ sưu tập lớn các ấn phẩm khoa học cho câu liên quan cho một mục tiêu khai thác được.Điều này đạt được trong hai bước. Đầu tiên, các văn...

Seal là một mô-đun Python cung cấp sự liên kết tự trên Hadoop.Seal là một ứng dụng của MapReduce cho sự liên kết chuỗi sinh học. Nó chạy trên Hadoop (http://hadoop.apache.org) thông qua Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), một Python MapReduce và HDFS...

avalanchetoolbox là một hộp công cụ để xác định và mô tả các quá trình phân nhánh, như tuyết lở thần kinh Yêu cầu . ...